仪器名称:分子相互作用仪 | |
品牌型号:Biacore X100 | |
摆放位置:第二理工楼723 | |
负责老师:李楠 第二理工楼709 | |
关键性能参数: 1.样品类型:从低分子量化合物到生物大分子如蛋白质、多肽、DNA、RNA、多糖、脂类分子以及细胞及病毒,包含DMSO溶液,血清及胞浆上清液。 2.结合速率常数(ka)范围:103-107 M-1s-1。 3.解离速率常数(kd)范围:10-5-10-1 s-1。 4.平衡亲和力(KD):10-4-10-12 M。 5.分子量检测限制:100道尔顿。 6.检测折射率范围:1.33-1.40。 7.响应信号动态范围:1-70000 RU。 8.浓度分析模式:标准曲线法或CFCA法。 9.系统流速:1-100 µL/min。 |
开机
1.从关机状态开机
(1)启动电脑和打印机,打开Biacore X100主机电源(右后侧下方),待主机面版上TEMP指示灯停止闪烁,即表示温度已稳定。
(2)启动 Biacore X100 Control Software,登入。
(3)待软件和主机建立连接,约30秒。
(4)确认左侧缓冲液瓶已装入新鲜缓冲液且两根缓冲液管均插入瓶中。
(5)确认右侧废液管已插入废液瓶中。
2.从待机状态开机
(1)确认左侧缓冲液瓶已装入新鲜缓冲液且两根缓冲液管均插入瓶中。
(2)确认右侧废液管已插入废液瓶中;启动控制软件并登入。
关机
1.准备一瓶去离子水和一瓶70%乙醇。
2.取出芯片,放入维护芯片。
3.选择Tools—〉Shutdown,根据程序要求完成指令。
4.程序将用去离子水和70%乙醇冲洗流路并排空IFC内的液体,约十分钟。当系统要求打开管道夹时,请打开前部下方面板,翻起管道夹。
5.关闭控制软件和电脑,清空废液瓶。
6.填写仪器使用情况记录本。
注意事项
1.仪器的上机操作需要在管理员老师的指导下完成。
2.缓冲液必须新鲜配制,并且用0.22μm的过滤器过滤去除杂质后才可以使用。
3.去离子水必须用0.22μm的过滤器过滤去除杂质,若使用的纯水仪已含该滤芯,可无需再次过滤。
4.配体和分析物需要为新鲜的、具有活性的样品,尽量现制现用或现买现用。
5.使用后的芯片短期保存用保鲜膜包好置于密闭的塑料袋中,放入4度冰箱冷藏;长期保存将芯片放入装有缓冲液的50ml离心管中,放入4度冰箱保存。
6. 拷取实验数据只能使用空白的光盘或格式化了的U盘。
1. 上机前的前期准备:
(1)CM5 传感芯片。CM5 芯片货号:BR100399(一片装),BR100012(三片装),29149604(十片装)。厂家为Cytiva。
(2)氨基偶联试剂盒(货号:BR-1000-50),厂家为Cytiva。
(3)偶联缓冲液:10mM 醋酸钠 pH4.0(货号:BR-1003-49),10mM 醋酸钠 pH4.5(货号:BR-1003-50),10mM 醋酸钠 pH5.0(货号:BR-1003-51),10mM 醋酸钠 pH5.5(货号:BR-1003-52),厂家为Cytiva。
(4)缓冲液:10 x HBS-EP+ (货号:BR-1006-69),厂家为Cytiva。或者自己配制其他缓冲液,用0.22um的过滤器过滤后使用。
(5)再生溶液Glycine 1.5 (货号:BR-1003-54)。
(6)去离子水(0.22 μm 膜过滤,若纯水仪已含该滤芯,可无需再次过滤直接使用)。
(7)无盖1.5 ml EP 管(货号:BR-1002-87),厂家为Cytiva。或者其他品牌1.5 ml EP管,上机前剪掉盖子。
(8)配体蛋白A:尽量现制现用或现买现用,如果为商业化蛋白粉末,用缓冲液稀释到>200 μg/ml,并分装后-20℃保存。溶解液尽量不含Tris 等带有伯氨基团的成分。
(9)流动相蛋白B:母液浓度尽量大于1uM,样品体积在200 μL 以上,纯度>80%。
利用Biacore X100 检测蛋白与蛋白结合的亲和力KD 与动力学数据ka,kd。使用CM5 芯片直接偶联蛋白A,蛋白B 作为分析物检测结合的亲和力。若要检测多个蛋白与不同蛋白的互作,可根据蛋白所带的tag,选择偶联相应的捕获分子如tag 标签抗体等,通过捕获法来进行检测。
示例二: Biacore X100 检测蛋白与核酸的相互作用
(1)SA 芯片,货号:BR100398(一片装)、BR100032(三片装),厂家为Cytiva。
(2)缓冲液:10 x HBS-EP+ (货号:BR-1006-69),厂家为Cytiva。或者自己配制其他缓冲液,用0.22um的过滤器过滤后使用。
(3)Condition 缓冲液:含50 mM NaOH 和1M NaCl 溶液,配制200 μL。
(4)Wash 缓冲液:含50%异丙醇、50 mM NaOH、1 M NaCl 溶液,配制200 μL。
(5)去离子水(0.22 μm 膜过滤,若纯水仪已含该滤芯,可无需再次过滤直接使用)。
(6)无盖1.5 ml EP 管(货号:BR-1002-87),厂家为Cytiva。或者其他品牌的1.5m EP管,上机前剪掉盖子。
(7)生物素化修饰的核酸:商业化合成的粉末,用去离子水稀释到100μg/mL,分装保存在-20℃。
(8)蛋白:母液浓度尽量大于1μM,样品体积在200 μL 以上,纯度>80%。(蛋白需要量可能因亲和力高低而异)。
(9)再生溶液:0.5% SDS。
2. 上机的操作建议:
利用Biacore X100 与 SA 芯片检测蛋白与核酸结合的动力学数据ka、kd 和亲和力数据KD。若有大量检测带biotin 标签的样品待检测,可选择Biotin CAPture Kit, Series S(货号:28-9202-34)来进行检测。
示例三: Biacore X100 捕获法检测抗原与抗体的相互作用
1. 上机前的前期准备:
(1)Protein A芯片。Protein A芯片货号:29127557(一片装),29127558(三片装)。厂家为 Cytiva。
(2)缓冲液:10 x HBS-EP+ (货号:BR-1006-69),厂家为Cytiva。或者自己配制其他缓冲液,用0.22um的过滤器过滤后使用。
(3)再生溶液 Glycine 1.5(货号:BR-1003-54)。
(4)去离子水(0.22um 膜过滤,若纯水仪已含该滤芯,可无需再次过滤直接使用)。
(5)无盖1.5 ml EP 管(货号:BR-1002-87),厂家为Cytiva。或者其他品牌的1.5m EP管,上机前剪掉盖子。
(6)抗体 A:浓度>200ug/ml。
(7)抗原 B:母液浓度尽量大于 1uM,样品体积在200WL 以上,纯度>80%。
2. 上机的操作建议:
利用 Biacore X100 检测抗原与抗体结合的亲和力 Ko与动力学数据Ka,Kd。使用 Portein A 芯片,捕获抗体 A,抗原B作为分析物,检测结合的亲和力与动力学。也可使用 CM5+ Human Antibody Capture Kit(货号:29234600)/Mouse Antibody Capture Kit(货号:29215281) 进行捕获法捕获抗体 A,抗原 B 作为流动相进行检测。